Folik asit, B12 ve demir gibi vitamin ve mineral eksiklikleri, bazı gıda alerjileri, bebeğin stres altında olması gibi durumlarda pamukçuk hastalığının nedenleri arasındadır. Ayrıca annedeki pamukçuk enfeksiyonu da emzirme yoluyla bebeğe geçebilir ya da bebekteki enfeksiyon annenin göğüslerinde enfeksiyon oluşmasına neden olabilir. Dezenfekte edilmeyen emzik ve biberon kullanımı ağız içinde enfeksiyon oluşturur.